Pokémon Tower (ポケモンタワー, Pokémon Tawā) constitue l'un des morceaux les plus atmosphériques et dérangeants de toute la franchise Pokémon. Junichi Masuda a composé ce thème pour accompagner l'exploration d'un cimetière de sept étages dédié aux Pokémon décédés, créant une mélodie qui semble littéralement "vous attaquer" selon les fans. Les notes discordantes, les motifs répétitifs inquiétants et l'utilisation de fréquences inhabituelles génèrent une sensation d'oppression unique qui distingue radicalement ce lieu de tout autre donjon du jeu. Cette composition audacieuse pour un jeu destiné aux enfants démontre la volonté de Game Freak de traiter le thème de la mort avec une gravité authentique.

La Tour Pokémon de Lavanville abrite des centaines de tombes sur ses sept étages, visitées quotidiennement par des dresseurs venus rendre hommage à leurs compagnons disparus. À partir du troisième étage, le joueur rencontre des Pokémon sauvages de type Spectre (Fantominus, Spectrum) et des Osselait, ainsi que des Médiums possédées par les esprits qui gardent les lieux. Sans le Scope Sylphe obtenu dans la Planque Rocket, les fantômes apparaissent comme des spectres non-identifiables impossibles à combattre, forçant le joueur à fuir. L'histoire tragique qui imprègne ce lieu culmine avec le fantôme d'une Ossatueur, mère d'un Osselait orphelin, tuée par la Team Rocket et dont l'esprit tourmenté bloque l'accès au septième étage jusqu'à ce qu'il soit apaisé par le combat.

Au sommet de la tour, M. Fuji, le bienveillant fondateur de la Maison des Pokémon Volontaires, est retenu captif par des Sbires Rocket (ou Jessie et James dans Pokémon Jaune). Après leur défaite, M. Fuji offre la Poké Flûte en remerciement, l'instrument magique capable de réveiller les deux Ronflex bloquant les routes vers le sud de Kanto. Ce thème musical résonne également dans la salle d'Agatha au Conseil des 4, la doyenne spécialiste des Pokémon Spectre, créant un lien thématique entre ces deux lieux hantés par les esprits. La Tour Pokémon sera transformée en Tour Radio dans la deuxième génération, les tombes étant déplacées vers la Maison des Âmes, mais son thème musical reste gravé dans la mémoire collective comme l'un des moments les plus marquants de l'aventure originale.