Deku Tree accompagne les premières cinématiques du jeu où le Grand Arbre Mojo, esprit gardien de la forêt Kokiri, s'adresse à la fée Navi pour lui confier la mission de guider Link. Koji Kondo a composé ce thème en Fa mineur, créant une atmosphère à la fois solennelle et empreinte de tristesse à travers un jeu subtil de tension et de résolution. Le tempo lent et les changements de basse reflètent le récit omineux que délivre l'Arbre Mojo sur le destin funeste qui menace Hyrule.

L'utilisation d'accords suspendus confère au morceau une qualité particulièrement poignante. En omettant la tierce des accords, Kondo prive la musique de sa résolution complète, laissant planer un sentiment de tristesse et d'incertitude. Cette technique musicale s'avère prophétique : bien que Link réussisse à briser la malédiction de Gohma, l'Arbre Mojo était condamné avant même le début de la quête. La musique reflète parfaitement cette réalité tragique, mêlant espoir ténu et acceptation mélancolique du destin.

Le Grand Arbre Mojo incarne l'archétype de l'arbre-monde présent dans de nombreuses mythologies, du Yggdrasil nordique à l'arbre Bodhi bouddhiste. Son thème évoque une sensibilité proche des traditions musicales du Moyen-Orient pour suggérer l'antiquité et la sagesse, une approche que Howard Shore emploiera plus tard pour les Elfes dans Le Seigneur des Anneaux. Cette figure paternelle pour Link constitue le premier des "temples organiques" du jeu, et sa mort précoce établit le ton émotionnel de toute l'aventure à venir.