Middle Boss Battle constitue le thème musical emblématique accompagnant tous les combats contre les mini-boss d'Ocarina of Time. Koji Kondo compose ici un morceau d'une intensité remarquable, caractérisé par des percussions martiales pressantes, des cuivres menaçants et une ligne mélodique agressive qui traduit parfaitement l'urgence de ces affrontements intermédiaires. Le tempo soutenu et les accents rythmiques créent une tension palpable qui pousse le joueur à rester constamment sur ses gardes face à des adversaires plus redoutables que les ennemis ordinaires.

Ce thème retentit pour la première fois dans la Caverne Dodongo lors de l'affrontement contre les Lizalfos, des guerriers reptiliens agiles capables d'esquiver et de contre-attaquer avec leurs épées. Par la suite, il accompagne une galerie variée d'adversaires redoutables : le Big Octo dans le Ventre de Jabu-Jabu, les Stalfos squelettiques du Temple de la Forêt, les Flare Dancers dansant dans les flammes du Temple du Feu, le White Wolfos de la Caverne de Glace, le terrifiant Dead Hand au Fond du Puits et au Temple de l'Ombre, ainsi que les redoutables Iron Knuckles du Temple de l'Esprit dont l'armure massive et la hache dévastatrice en font parmi les ennemis les plus dangereux du jeu.

L'affrontement le plus mémorable accompagné par ce thème reste sans conteste celui contre Dark Link dans le Temple de l'Eau. Ce doppelgänger ténébreux surgit d'une salle illusoire recouverte d'eau, près d'un arbre mort et desséché, après que le reflet de Link dans l'eau ait mystérieusement disparu. Dark Link possède le même nombre de cœurs que le héros au moment de la rencontre, copie la plupart de ses mouvements, peut sauter sur sa lame lorsqu'il attaque et devient progressivement plus agressif et opaque au fil du combat. Cet ennemi emblématique, considéré comme l'un des plus difficiles du jeu, incarne le conseil de Navi : "Conquiers-toi toi-même !" Le thème musical souligne parfaitement cette confrontation psychologique entre Link et son reflet corrompu, transformant chaque rencontre avec un mini-boss en un moment de tension inoubliable.